More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8422 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  100 
 
 
399 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  37.8 
 
 
379 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  46.43 
 
 
473 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  42.02 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  41.16 
 
 
390 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0239  hypothetical protein  32.9 
 
 
382 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  32.13 
 
 
394 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
390 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  31.61 
 
 
390 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
414 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  31.35 
 
 
390 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  31.35 
 
 
414 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
390 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  31.09 
 
 
390 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  31.09 
 
 
431 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0239  hypothetical protein  32.64 
 
 
382 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
389 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  36.04 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  36.53 
 
 
391 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  36.63 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  36.27 
 
 
416 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.96 
 
 
408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  36.36 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
388 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  34.1 
 
 
394 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  36 
 
 
391 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.86 
 
 
391 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
398 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
385 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  35.28 
 
 
389 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  35.28 
 
 
389 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  35.54 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 
398 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.58 
 
 
388 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.15 
 
 
392 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  35.01 
 
 
389 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.29 
 
 
390 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  37.99 
 
 
411 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.65 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
397 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.01 
 
 
390 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.01 
 
 
390 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  35 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  34.48 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.89 
 
 
385 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
400 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0483  major facilitator transporter  37.43 
 
 
426 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.964479  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  36.9 
 
 
400 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  34.78 
 
 
405 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  34.6 
 
 
400 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33.6 
 
 
388 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
391 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.15 
 
 
388 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  34.6 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  32.69 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1714  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.8 
 
 
400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
400 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  34.58 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  34.82 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  34.07 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.32 
 
 
391 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  35.75 
 
 
400 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  34.17 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  34.17 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  34.17 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  34.17 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  34.34 
 
 
389 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  32.6 
 
 
412 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
391 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  34.07 
 
 
388 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  33.92 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  33.92 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
406 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.39 
 
 
391 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  35.83 
 
 
391 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  34.59 
 
 
400 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  34.59 
 
 
400 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  34.51 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  32.01 
 
 
388 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  34.83 
 
 
409 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  34.83 
 
 
399 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  34.83 
 
 
399 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  35.75 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.62 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2491  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259249  normal  0.0455344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  30.99 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  33.62 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  34.64 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  33.98 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  30.95 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>