More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0416 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  747    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  37.94 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  35.48 
 
 
390 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
397 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.82 
 
 
388 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
388 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  36.74 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.46 
 
 
391 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.53 
 
 
392 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.46 
 
 
391 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  30.03 
 
 
398 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.2 
 
 
391 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  36.44 
 
 
390 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.06 
 
 
396 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  32.64 
 
 
416 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34.85 
 
 
390 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  36.51 
 
 
392 aa  156  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.72 
 
 
388 aa  156  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.12 
 
 
390 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.7 
 
 
405 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.12 
 
 
390 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.12 
 
 
390 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.12 
 
 
390 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  32.64 
 
 
391 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.12 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.85 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.98 
 
 
390 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  29.66 
 
 
400 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
408 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.6 
 
 
391 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.6 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.47 
 
 
409 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.83 
 
 
390 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.3 
 
 
397 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.33 
 
 
391 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.87 
 
 
391 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.36 
 
 
400 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
392 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.53 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.33 
 
 
391 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  32.94 
 
 
390 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  39.02 
 
 
378 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
385 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.29 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  34.48 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  37.12 
 
 
400 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  35.24 
 
 
411 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  32.86 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
404 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  34.83 
 
 
407 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  36.13 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  32.23 
 
 
412 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.14 
 
 
391 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  34.22 
 
 
406 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
404 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.37 
 
 
415 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.65 
 
 
389 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  34.85 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
391 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  34.3 
 
 
400 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  34.2 
 
 
383 aa  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.37 
 
 
415 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.37 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  32.39 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  32.39 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  33.43 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  28.81 
 
 
379 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
400 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  32.48 
 
 
389 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.33 
 
 
388 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.2 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  34.46 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.59 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  27.73 
 
 
391 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  31.76 
 
 
391 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  34.46 
 
 
388 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
394 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  32.7 
 
 
401 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  32.47 
 
 
401 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
393 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  34.09 
 
 
400 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  32.7 
 
 
401 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  32.7 
 
 
401 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.72 
 
 
395 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  30.5 
 
 
421 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  32.4 
 
 
401 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.72 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>