More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2232 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 379 aa  735    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0239  hypothetical protein  38.87 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  38.42 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0239  hypothetical protein  39.7 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 473 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.63 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.63 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  25.85 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  25.85 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  29.02 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4809  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  27.64 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  27.35 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0485  putative transporter  27.35 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.425547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0483  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 426 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.964479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  25.54 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.29 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  25.93 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1714  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  29.33 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  29.33 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  34.62 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  28.36 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  25.43 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  25.43 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  25.43 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  26.36 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  25.14 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  25.68 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2491  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259249  normal  0.0455344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  25.14 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.56 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>