More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0239 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0239  hypothetical protein  98.17 
 
 
382 aa  725    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0239  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  737    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  40.35 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  34.34 
 
 
399 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.37 
 
 
406 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  28.61 
 
 
390 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.06 
 
 
390 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  29.82 
 
 
473 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
389 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  27.11 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  25.93 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  28 
 
 
421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  24.61 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  25.4 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  25.4 
 
 
391 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
393 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  24.87 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  25.27 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  25 
 
 
392 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  25.93 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  26.59 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  24.09 
 
 
388 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
390 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  25.29 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
400 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  26.08 
 
 
391 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
392 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  26.04 
 
 
389 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
398 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
388 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  24.93 
 
 
390 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  25.41 
 
 
408 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  25 
 
 
388 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  28.49 
 
 
394 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
390 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  24.07 
 
 
385 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
398 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
391 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  26.1 
 
 
383 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  27.97 
 
 
390 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  27.97 
 
 
390 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  24.93 
 
 
391 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  27.97 
 
 
390 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  25.21 
 
 
383 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
414 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
390 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
414 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
390 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  28.24 
 
 
431 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  24.36 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
385 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  25.21 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  24.36 
 
 
391 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  25.49 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  25.21 
 
 
400 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  25.49 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  25.35 
 
 
399 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  25.35 
 
 
409 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  27.25 
 
 
397 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  25.35 
 
 
399 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  25.49 
 
 
400 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  25.68 
 
 
400 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  25.41 
 
 
397 aa  99.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  24.44 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  27.97 
 
 
390 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  27.35 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  27.35 
 
 
397 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  26.67 
 
 
394 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  25.84 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2289  transporter, putative  24.32 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00964555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  26.04 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  24.43 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  27 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  25.7 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  26.21 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  25 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  26.1 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  25.69 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
400 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  25.72 
 
 
400 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  25.21 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  25.14 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  25.14 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  24.79 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  25.45 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>