More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0490 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  752    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  37.36 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  35.29 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  34.66 
 
 
390 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
398 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.42 
 
 
408 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  29.71 
 
 
379 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  33.92 
 
 
394 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
408 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.41 
 
 
409 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0483  major facilitator transporter  33.99 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.964479  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  30.66 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  30.95 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
414 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
397 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  30.66 
 
 
394 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.58 
 
 
400 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  30.95 
 
 
390 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  30.66 
 
 
390 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  30.66 
 
 
390 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  33.58 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  33.24 
 
 
383 aa  136  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  34.36 
 
 
400 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  30.25 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  34.2 
 
 
411 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  34.08 
 
 
400 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.04 
 
 
405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0239  hypothetical protein  30.1 
 
 
382 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  36.84 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  30.66 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.27 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  33.04 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.83 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.11 
 
 
392 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.56 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.56 
 
 
391 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  32.36 
 
 
390 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  31.23 
 
 
400 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
404 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  32.68 
 
 
400 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.36 
 
 
391 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  32.87 
 
 
400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32.68 
 
 
400 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  31.45 
 
 
390 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  32.4 
 
 
400 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  34.25 
 
 
403 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.4 
 
 
400 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
386 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.1 
 
 
394 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.36 
 
 
391 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
405 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.73 
 
 
391 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.68 
 
 
404 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  32.41 
 
 
391 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  31.3 
 
 
421 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.65 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.17 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  34.05 
 
 
391 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.97 
 
 
389 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  30.42 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.97 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.97 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  38.12 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.24 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.97 
 
 
389 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
388 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.83 
 
 
388 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.43 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.43 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.34 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.77 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.43 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.43 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  35.1 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.43 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28.43 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.77 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.28 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.56 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.64 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.56 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
404 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  33.97 
 
 
425 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  27.88 
 
 
415 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  27.88 
 
 
415 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4738  MFS transporter, DHA1 family  34.81 
 
 
404 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  29.33 
 
 
405 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>