More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2289 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2289  transporter, putative  100 
 
 		 391 aa  762    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00964555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  35.09 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  32.1 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.1 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.38 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.17 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  30.73 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.44 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  28.76 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 389 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.47 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  30.79 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.47 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.18 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  32.76 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.18 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 389 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  29.46 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.18 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  28.33 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  32.85 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>