More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1714 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1714  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  746    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  37.15 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  36.8 
 
 
406 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
408 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  33.69 
 
 
394 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
398 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  30.34 
 
 
390 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.86 
 
 
394 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  30.06 
 
 
390 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
389 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
414 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  29.58 
 
 
390 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
390 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
414 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
390 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  29.41 
 
 
431 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  29.01 
 
 
390 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  34.28 
 
 
390 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  37.11 
 
 
399 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  33.05 
 
 
399 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  33.05 
 
 
409 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  33.05 
 
 
399 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  32.21 
 
 
415 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
415 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  36.12 
 
 
401 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
404 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  32.58 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  31.84 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  33.46 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  33.08 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  33.05 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.46 
 
 
404 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  31.13 
 
 
421 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  32.1 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35860  Major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 
402 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0563948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  33.06 
 
 
383 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.03 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
404 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  34.75 
 
 
386 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.92 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.27 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.75 
 
 
390 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  26.12 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  33.46 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08010  arabinose efflux permease family protein  34.75 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.862612  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.99 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.86 
 
 
414 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  35.45 
 
 
400 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
397 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  31.49 
 
 
392 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4809  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
418 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942167  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  31.98 
 
 
400 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.44 
 
 
391 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.44 
 
 
391 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  34.56 
 
 
403 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  33.6 
 
 
383 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  34.33 
 
 
400 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  35.14 
 
 
398 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  34.56 
 
 
400 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  35.07 
 
 
400 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.16 
 
 
391 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  34.33 
 
 
400 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  35.07 
 
 
400 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  30.66 
 
 
391 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  30.77 
 
 
392 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.83 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  30.51 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.88 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  34.36 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  34.98 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  30.11 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.08 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
317 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  32.07 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  35.5 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.56 
 
 
391 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.17 
 
 
391 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1815  major facilitator transporter  29.72 
 
 
382 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.56 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.17 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.62 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.17 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  27.99 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.21 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.59 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  34.94 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>