More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08010  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 394 aa  736    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.862612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01240  arabinose efflux permease family protein  48.07 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0128  major facilitator superfamily protein  41.98 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  33.42 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26710  arabinose efflux permease family protein  39.58 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  31.57 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4738  MFS transporter, DHA1 family  42.2 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  34.84 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.49 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4736  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  30.03 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  35.5 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.22 
 
 		 391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.48 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.22 
 
 		 391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.22 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  33.88 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.95 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  35.08 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 395 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  34.74 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  35.46 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.7 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  31.75 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.98 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  29.91 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2491  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259249  normal  0.0455344 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.34 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  28.15 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>