More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0128 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0128  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
394 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08010  arabinose efflux permease family protein  41.53 
 
 
394 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.862612  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  38.31 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4738  MFS transporter, DHA1 family  43.71 
 
 
404 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  36.96 
 
 
390 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
405 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  37.46 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1726  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 
396 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0692378  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01240  arabinose efflux permease family protein  37.39 
 
 
353 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26710  arabinose efflux permease family protein  39.62 
 
 
399 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34.36 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.58 
 
 
404 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.87 
 
 
404 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
404 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.09 
 
 
404 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  28.57 
 
 
415 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.57 
 
 
390 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  35.29 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.52 
 
 
388 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  38.78 
 
 
394 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
394 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  37.22 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  37.59 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  37.41 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  37.45 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  37.41 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.24 
 
 
391 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.08 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
390 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  37.04 
 
 
400 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
390 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
390 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  37.41 
 
 
400 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
390 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.61 
 
 
390 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  26.89 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  36.6 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.51 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.3 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.7 
 
 
394 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.8 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.7 
 
 
390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.42 
 
 
390 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4736  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
410 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
398 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
398 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.15 
 
 
400 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.3 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  37.81 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  33.54 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.99 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.42 
 
 
390 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
397 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  34.39 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.26 
 
 
391 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.68 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.03 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.85 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.16 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.12 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  30 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  32.3 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  36.36 
 
 
400 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.67 
 
 
405 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.54 
 
 
391 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.87 
 
 
391 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.87 
 
 
391 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.26 
 
 
391 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.13 
 
 
391 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
397 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  31.29 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.87 
 
 
391 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.89 
 
 
391 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.24 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.24 
 
 
395 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  32.31 
 
 
390 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.7 
 
 
391 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  32.65 
 
 
397 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.77 
 
 
389 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.61 
 
 
391 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  36.72 
 
 
388 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>