More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35860  Major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
402 aa  769    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0563948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1815  major facilitator transporter  80.9 
 
 
382 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4906  major facilitator transporter  52.92 
 
 
415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
391 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  38.4 
 
 
391 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2836  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
390 aa  209  9e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.810212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.04 
 
 
388 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1728  transporter, putative  28.24 
 
 
391 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.292388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
395 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  34.52 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  33.08 
 
 
414 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  36.31 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
391 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  35.43 
 
 
400 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
392 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.87 
 
 
391 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.1 
 
 
405 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  35.69 
 
 
391 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  35.64 
 
 
393 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.81 
 
 
390 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
390 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
390 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
390 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
390 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.51 
 
 
390 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
400 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  34.22 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  33.75 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.63 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.33 
 
 
395 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.92 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.74 
 
 
388 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
386 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  33.75 
 
 
408 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
400 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
388 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  34.88 
 
 
401 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.61 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  33.13 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  33.13 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  33.13 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  34.05 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.01 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.16 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 
400 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 
411 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  32.83 
 
 
422 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
397 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
404 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.27 
 
 
391 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
388 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.45 
 
 
391 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  29.6 
 
 
390 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
408 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.16 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  30.66 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.86 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.86 
 
 
391 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  30.37 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  31.25 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.7 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
407 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  31.31 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  34.12 
 
 
393 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  33.63 
 
 
392 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  33.33 
 
 
389 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  34.13 
 
 
407 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.29 
 
 
408 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  29.03 
 
 
395 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
391 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.68 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.25 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
403 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  30.93 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.56 
 
 
416 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.56 
 
 
391 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  29.4 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.68 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  31.32 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.68 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.41 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
402 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  30.68 
 
 
388 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  32.54 
 
 
386 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  32.54 
 
 
386 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  32.54 
 
 
386 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  29.62 
 
 
384 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 
403 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  28.87 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.41 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  30.43 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0309289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>