More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1728 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1728  transporter, putative  100 
 
 
391 aa  765    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.292388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2836  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 
390 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.810212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  36.1 
 
 
391 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35860  Major facilitator superfamily transporter  28.32 
 
 
402 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0563948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1815  major facilitator transporter  27.56 
 
 
382 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4906  major facilitator transporter  26.32 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  24.78 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  26.03 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  26.49 
 
 
397 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.69 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.09 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
404 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.52 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.12 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0425  MFS transport protein AraJ  23.91 
 
 
422 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.87857  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  26.14 
 
 
389 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  26.14 
 
 
389 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  26.14 
 
 
389 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  24.34 
 
 
392 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  24.28 
 
 
403 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  24.28 
 
 
391 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  25.93 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  24.8 
 
 
388 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  26.52 
 
 
388 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  26.95 
 
 
404 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0471  MFS transport protein AraJ  24.22 
 
 
422 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  27.38 
 
 
403 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0423  MFS transport protein AraJ  24.22 
 
 
422 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0463  MFS transport protein AraJ  24.22 
 
 
422 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  24.8 
 
 
388 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0315  MFS transport protein AraJ  24.22 
 
 
422 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  24.78 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.01 
 
 
388 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  27.55 
 
 
406 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  25.53 
 
 
390 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  26.63 
 
 
384 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
404 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
408 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3213  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
422 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3237  MFS transport protein AraJ  23.83 
 
 
394 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.691392  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  27.44 
 
 
407 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  22.86 
 
 
395 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
409 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  25.86 
 
 
398 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
388 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
388 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  24.8 
 
 
390 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
420 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  25.7 
 
 
393 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
399 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  24.8 
 
 
390 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  22.6 
 
 
395 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00344  predicted transporter  23.83 
 
 
394 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00348  hypothetical protein  23.83 
 
 
394 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  23.45 
 
 
391 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  25.79 
 
 
400 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0450  MFS transport protein AraJ  22.66 
 
 
408 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0431  MFS transport protein AraJ  22.66 
 
 
390 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.67 
 
 
387 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  24.8 
 
 
391 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  23.77 
 
 
409 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  27.51 
 
 
407 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  25.71 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
405 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  23.98 
 
 
400 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0432  MFS transport protein AraJ  22.66 
 
 
408 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  23.18 
 
 
391 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0492  MFS transport protein AraJ  22.66 
 
 
390 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
390 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  28.1 
 
 
388 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  24.41 
 
 
391 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  22.92 
 
 
391 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
402 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  22.66 
 
 
391 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2287  major facilitator transporter  25.77 
 
 
387 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  22.78 
 
 
404 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  25.2 
 
 
411 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>