More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4906 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4906  major facilitator transporter  100 
 
 
415 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35860  Major facilitator superfamily transporter  52.92 
 
 
402 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0563948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1815  major facilitator transporter  49.18 
 
 
382 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  36.1 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
391 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2836  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.810212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0640  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403686  normal  0.404462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
392 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1728  transporter, putative  26.32 
 
 
391 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.292388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.34 
 
 
414 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  29.81 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  31.77 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  31.62 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  31.93 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  30.91 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  29.72 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
400 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3762  major facilitator transporter  33.82 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147545  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  32.2 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.63 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  28.44 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.43 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  32.11 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1617  major facilitator family transporter  34.45 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  31.88 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  29.68 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2688  major facilitator family transporter  35.46 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.62 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  33.23 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  30.89 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  33.23 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  32.11 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  33.23 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
409 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26110  putative MFS transporter  34.99 
 
 
392 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.463026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
385 aa  126  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  32.11 
 
 
401 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  35.86 
 
 
384 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
391 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  29.82 
 
 
403 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  32.54 
 
 
386 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.14 
 
 
391 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  30.79 
 
 
390 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  28.81 
 
 
416 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  28.74 
 
 
386 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29.01 
 
 
391 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  28.74 
 
 
386 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
388 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.57 
 
 
388 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  28.74 
 
 
386 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  29.4 
 
 
391 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  29.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  29.34 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.14 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  29.94 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  32.27 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  29.57 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.14 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  30.49 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  29.83 
 
 
390 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  29.44 
 
 
399 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.71 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  31.87 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  28.13 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  28.86 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  30.77 
 
 
393 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.14 
 
 
391 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.14 
 
 
391 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  30.21 
 
 
391 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  27.86 
 
 
403 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  28.86 
 
 
391 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  29.05 
 
 
400 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  28.29 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.22 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  29.62 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  28.94 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.64 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  28.98 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  29.88 
 
 
389 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.86 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.5 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  26.76 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  27.14 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  28.5 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>