More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1815 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1815  major facilitator transporter  100 
 
 		 382 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35860  Major facilitator superfamily transporter  81.54 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0563948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4906  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2836  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.810212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.33 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  34.25 
 
 		 395 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1728  transporter, putative  26.65 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.292388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.53 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  32.84 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.72 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  33.44 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.24 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.95 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  30.31 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  29.76 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.68 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 407 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  30.95 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  33.53 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  33.71 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.33 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  28.33 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  30.72 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.06 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.33 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>