More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00348 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00344  predicted transporter  100 
 
 		 394 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3213  major facilitator superfamily MFS_1  99.75 
 
 		 422 aa  774    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00348  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0315  MFS transport protein AraJ  99.49 
 
 		 422 aa  772    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3237  MFS transport protein AraJ  99.75 
 
 		 394 aa  773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.691392  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0450  MFS transport protein AraJ  85.05 
 
 		 408 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0437  MFS transport protein AraJ  84.28 
 
 		 390 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0471  MFS transport protein AraJ  99.24 
 
 		 422 aa  770    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0423  MFS transport protein AraJ  99.24 
 
 		 422 aa  770    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0431  MFS transport protein AraJ  84.79 
 
 		 390 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0492  MFS transport protein AraJ  85.05 
 
 		 390 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0425  MFS transport protein AraJ  98.48 
 
 		 422 aa  764    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.87857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0463  MFS transport protein AraJ  99.24 
 
 		 422 aa  770    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0432  MFS transport protein AraJ  84.79 
 
 		 408 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2050  MFS transport protein AraJ  74.23 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1776  arabinose efflux permease  38.78 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2302  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  39.19 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  33.25 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.02 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.66 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 391 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 406 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  34.18 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  35.96 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.61 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  33.61 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  36.06 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  36.06 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  33.42 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  33.33 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  35.77 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  35.77 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  35.77 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  32.73 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  35.77 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  35.88 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  32.64 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  34.66 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.85 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  33.8 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>