More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0437 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00344  predicted transporter  84.28 
 
 		 394 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3213  major facilitator superfamily MFS_1  84.54 
 
 		 422 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0471  MFS transport protein AraJ  84.28 
 
 		 422 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0315  MFS transport protein AraJ  84.54 
 
 		 422 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0492  MFS transport protein AraJ  98.21 
 
 		 390 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0450  MFS transport protein AraJ  98.46 
 
 		 408 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3237  MFS transport protein AraJ  84.54 
 
 		 394 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.691392  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00348  hypothetical protein  84.28 
 
 		 394 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0431  MFS transport protein AraJ  98.72 
 
 		 390 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0423  MFS transport protein AraJ  84.28 
 
 		 422 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0425  MFS transport protein AraJ  83.76 
 
 		 422 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.87857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0463  MFS transport protein AraJ  84.28 
 
 		 422 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0437  MFS transport protein AraJ  100 
 
 		 390 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0432  MFS transport protein AraJ  98.97 
 
 		 408 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2050  MFS transport protein AraJ  74.29 
 
 		 405 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2302  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1776  arabinose efflux permease  37.4 
 
 		 396 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  39.02 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.8 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 405 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  35.23 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.98 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.96 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  34.43 
 
 		 414 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  35.67 
 
 		 403 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  33.16 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33.51 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.47 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  32.03 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.45 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 394 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  34.3 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  35.8 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 391 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  34.32 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  34.09 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  35.51 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  35.51 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>