More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1776 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1776  arabinose efflux permease  100 
 
 
396 aa  783    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2302  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 
411 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.83 
 
 
388 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00344  predicted transporter  37.47 
 
 
394 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0423  MFS transport protein AraJ  37.37 
 
 
422 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0471  MFS transport protein AraJ  37.37 
 
 
422 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00348  hypothetical protein  37.47 
 
 
394 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3237  MFS transport protein AraJ  37.47 
 
 
394 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.691392  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0463  MFS transport protein AraJ  37.37 
 
 
422 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3213  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
422 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0425  MFS transport protein AraJ  37.37 
 
 
422 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.87857  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0315  MFS transport protein AraJ  37.47 
 
 
422 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2050  MFS transport protein AraJ  38.24 
 
 
405 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
386 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0492  MFS transport protein AraJ  38.11 
 
 
390 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0450  MFS transport protein AraJ  38.38 
 
 
408 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0432  MFS transport protein AraJ  38.11 
 
 
408 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0431  MFS transport protein AraJ  38.11 
 
 
390 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
397 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0437  MFS transport protein AraJ  37.57 
 
 
390 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  36.13 
 
 
430 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
405 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  35.86 
 
 
414 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36.52 
 
 
405 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34.15 
 
 
392 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 
392 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.4 
 
 
391 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.29 
 
 
391 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
400 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  36.24 
 
 
403 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.01 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.47 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.72 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  34.75 
 
 
411 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.01 
 
 
416 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
388 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34.47 
 
 
390 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  34.19 
 
 
390 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.01 
 
 
391 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.14 
 
 
391 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.81 
 
 
408 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.33 
 
 
388 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  32.98 
 
 
409 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  34.09 
 
 
406 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  36.36 
 
 
403 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  34.79 
 
 
382 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 
400 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  35.03 
 
 
391 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
409 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
391 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
409 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
399 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  34.59 
 
 
411 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  38.28 
 
 
407 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  35.71 
 
 
416 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  37.05 
 
 
393 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  33.6 
 
 
392 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
414 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  34.45 
 
 
425 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  34.04 
 
 
399 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.57 
 
 
391 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  34.31 
 
 
389 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  36.08 
 
 
407 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  33.43 
 
 
384 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
420 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  34.83 
 
 
391 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  31.3 
 
 
407 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  34.25 
 
 
391 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  34.01 
 
 
422 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  32.73 
 
 
395 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.31 
 
 
388 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
402 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  33.43 
 
 
360 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  38.8 
 
 
423 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
386 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.89 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  32.57 
 
 
389 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  35.89 
 
 
395 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.05 
 
 
388 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  35.39 
 
 
391 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  31.95 
 
 
406 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
393 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  32.27 
 
 
401 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  35.79 
 
 
393 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  34.18 
 
 
411 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  31.64 
 
 
385 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  33.05 
 
 
388 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
392 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.29 
 
 
388 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  34.63 
 
 
403 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
411 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>