More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4007 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  97.93 
 
 		 387 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  730    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  730    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  86.51 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4572  major facilitator transporter  79.95 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  50 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  39.14 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  38.61 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  37.69 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  37.44 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  37.44 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21300  putative MFS transporte  49.85 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  37.86 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1820  MFS family transporter  48.22 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  36.62 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.81 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  30.87 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.72 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.47 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.49 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.47 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.47 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.46 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  32.25 
 
 		 400 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  36.05 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  31.98 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.77 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  28.79 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.79 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.79 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26710  arabinose efflux permease family protein  35.21 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  31.61 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7916  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.72 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.85 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.72 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  27.38 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  29.89 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>