More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3260 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  100 
 
 		 372 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  73.05 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  72.24 
 
 		 382 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  65.16 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  40.49 
 
 		 417 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  34.73 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.95 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  35.71 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  35.47 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  35.99 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  27.45 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  27.45 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  27.45 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  27.17 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.55 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.66 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 419 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  31.7 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  31.7 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.57 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  28.86 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  28.28 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.51 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.57 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  30.53 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.57 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  37.65 
 
 		 411 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.67 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.41 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>