More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2382 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  927    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 475 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  29.39 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  23.44 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  22.85 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.88 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 850 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  22.85 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.46 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  23.89 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.46 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.46 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.46 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  19.87 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.93 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  24.59 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  24.19 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  23.06 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  24.19 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  24.19 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  23.59 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  23.06 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  24.31 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  20.07 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  25 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  25 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  25 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.9 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.9 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.16 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>