More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3590 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  906    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  94.51 
 
 		 475 aa  831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  27.2 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.95 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.58 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.84 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.883697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 918 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.35 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 417 aa  57  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 381 aa  57  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.75 
 
 		 555 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06063  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08910)  26.8 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  28.16 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  22.81 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  22.81 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  25.64 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 525 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  30.57 
 
 		 198 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.41 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 627 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05628  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11060)  22.68 
 
 		 592 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.578894  normal  0.0253476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 424 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 530 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>