More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5307 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  851    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  56.8 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  49.14 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  68.97 
 
 		 217 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  35.12 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  32.15 
 
 		 403 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  31.9 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  27.07 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  28.29 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.24 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.27 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  25.73 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.34 
 
 		 400 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.14 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 382 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  28.7 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  26.04 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  27.69 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  27.07 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.95 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  28.65 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  29.23 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  29.23 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  30.23 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  30.23 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.72 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1794  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  23.49 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  29.29 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.67 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.62 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.26 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  23.11 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.38 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.52 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  23.11 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  27.21 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 697 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  33.53 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>