More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3971 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  94.78 
 
 		 474 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  100 
 
 		 475 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  26.55 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 426 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.92 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  26.22 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 525 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 404 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  22.48 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  22.48 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.25 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 494 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.883697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.62 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.32 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 		 509 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 442 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 609 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.28 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.32 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>