More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0783 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  52.56 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.33 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1700  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.59 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.36 
 
 		 412 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  36.32 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.75 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0944  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.81 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0611757  hitchhiker  0.00545793 
 
 
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NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.37 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.51 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.157805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.1 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.71 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.46 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.52 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  32.11 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  34.22 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.4 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.75 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.62 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  36.46 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.37 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.75 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.73 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 405 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.39 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.66 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.87 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  34.38 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.56 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.61 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.6 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.47 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.44 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.19 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.31 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.08 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.64 
 
 		 414 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_22680  arabinose efflux permease family protein  29.41 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466156  normal  0.68733 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.33 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.2 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.07 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.68 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  27.81 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.5 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  34.15 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.75 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.42 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.97 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.56 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  33.52 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  34.04 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.54 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.72 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.77 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.23 
 
 		 416 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.91 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.28 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.62 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.01 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.51 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.28 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.67 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.8 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.67 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.76 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  26.04 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.4 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.29 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.29 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.56 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.93 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.27 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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