More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0399 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 422 aa  842    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  56.42 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
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NC_009051  Memar_1700  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  55.33 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  46.33 
 
 		 398 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.61 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0944  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.24 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0611757  hitchhiker  0.00545793 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  37.06 
 
 		 404 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
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NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.27 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.28 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.14 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.157805  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.56 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.75 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_22680  arabinose efflux permease family protein  31.99 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466156  normal  0.68733 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.89 
 
 		 411 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.45 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.25 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.2 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.86 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.79 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.95 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.62 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  33.07 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.8 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  33.71 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.12 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.92 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 399 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.25 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  29.77 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.75 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  32.01 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.8 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.99 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.95 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.9 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.96 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.41 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.33 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.15 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.86 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.69 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.5 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  32.31 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  32.31 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.4 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.35 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.55 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  28.42 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.22 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.13 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.13 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.25 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.53 
 
 		 413 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.79 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.25 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.44 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.88 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.89 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 419 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.95 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.51 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.1 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.1 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.2 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  29.35 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.75 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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