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for query gene Shel_22680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22680  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 409 aa  813    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466156  normal  0.68733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.34 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1700  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.58 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.99 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.7 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0944  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.68 
 
 		 388 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0611757  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.41 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  25.68 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.55 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  32.77 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.82 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.77 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.47 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  35.37 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.02 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.55 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.8 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.14 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.74 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_007519  Dde_0668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.157805  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.92 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  28.42 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.5 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.17 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.01 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.62 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.97 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.39 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.51 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.44 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.2 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.53 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.2 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.37 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.09 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.12 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.93 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.72 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.2 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  30.15 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.09 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.62 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.74 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.18 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.08 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  28.14 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.1 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.51 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.07 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.69 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  28.14 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.11 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2102  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.7 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.82 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.59 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.18 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.91 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.11 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.94 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.62 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.91 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.94 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.47 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
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NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.54 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3182  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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