More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 408 aa  801    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.71 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.02 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1700  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.26 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 398 aa  216  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.62 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  32.28 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0944  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.96 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0611757  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22680  arabinose efflux permease family protein  33.07 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466156  normal  0.68733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  40.56 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  37.59 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.11 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.11 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.14 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.14 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.69 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.57 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.89 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.86 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.86 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.86 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.86 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.86 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.03 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.75 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.14 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.52 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.51 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.48 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.33 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.4 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.21 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.18 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.59 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.76 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.157805  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.82 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.18 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.77 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.88 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 		 411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.55 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.8 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.38 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.38 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.38 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.92 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.6 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.94 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.52 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.98 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.46 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.11 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.09 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.73 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.53 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.02 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  31.1 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  31.1 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.06 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.87 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.66 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.85 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.85 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.99 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.48 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.64 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.59 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.93 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.85 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.81 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  32.42 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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