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for query gene Ssed_3575 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 413 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.7 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.24 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.01 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.61 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.97 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.38 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.34 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.5 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.95 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3182  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.94 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.94 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  28.65 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.88 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.73 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.42 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.42 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.71 
 
 		 396 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.39 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.42 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.42 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.27 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.39 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.17 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.36 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.53 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.08 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.14 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.66 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.11 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.66 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.34 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.5 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  29.01 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.29 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.89 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.65 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.2 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  28.02 
 
 		 426 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  29.47 
 
 		 400 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.39 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.04 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.87 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.73 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.58 
 
 		 396 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.49 
 
 		 420 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.25 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.33 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.34 
 
 		 498 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.16 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.05 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.48 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.98 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.31 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.83 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.01 
 
 		 398 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.03 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.6 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.51 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.78 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.01 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.2 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.17 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.91 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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