More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0685 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  844    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  37.73 
 
 
453 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  33.1 
 
 
447 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.07 
 
 
443 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  31.93 
 
 
433 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.82 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.95 
 
 
454 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  28.12 
 
 
457 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  28.12 
 
 
457 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.47 
 
 
472 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  31.99 
 
 
468 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
478 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.3 
 
 
464 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.77 
 
 
465 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  28.61 
 
 
433 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
440 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  32.35 
 
 
465 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.25 
 
 
475 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.6 
 
 
470 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  32.35 
 
 
467 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.79 
 
 
437 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.83 
 
 
451 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.99 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.33 
 
 
490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.98 
 
 
464 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.97 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.02 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.27 
 
 
450 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.67 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  29.16 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  27.78 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.37 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.82 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.06 
 
 
461 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.74 
 
 
440 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.73 
 
 
441 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.16 
 
 
453 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.93 
 
 
433 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.61 
 
 
446 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
426 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.56 
 
 
443 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.47 
 
 
461 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  30.81 
 
 
453 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.21 
 
 
578 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.07 
 
 
448 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 
426 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
426 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.94 
 
 
454 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  31.78 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  36.89 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.9 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.78 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  35.1 
 
 
542 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.94 
 
 
457 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.5 
 
 
430 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.75 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  33.81 
 
 
530 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.96 
 
 
438 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
434 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.72 
 
 
441 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.03 
 
 
460 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.33 
 
 
416 aa  86.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.56 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.28 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.85 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30.33 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.1 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.74 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.67 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.79 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.91 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.57 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.2 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  33.17 
 
 
533 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.91 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  31.5 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.82 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.84 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.64 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  37.16 
 
 
198 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  27.8 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.52 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.76 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.15 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  28.37 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.84 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  31.84 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>