More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1871 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  94.09 
 
 
423 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  74.64 
 
 
435 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  96.93 
 
 
423 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  75.53 
 
 
430 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  96.22 
 
 
423 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  94.09 
 
 
443 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  96.22 
 
 
423 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  75.3 
 
 
430 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  76.61 
 
 
432 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 
433 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 
433 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  56.17 
 
 
435 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  54.27 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  49.88 
 
 
433 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  50.35 
 
 
472 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  49.4 
 
 
434 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  49.4 
 
 
433 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  50.35 
 
 
472 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  50.12 
 
 
433 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  49.4 
 
 
434 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  50.35 
 
 
432 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  49.16 
 
 
432 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  48.39 
 
 
434 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  48.39 
 
 
434 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  48.39 
 
 
434 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  48.39 
 
 
434 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  48.39 
 
 
434 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  49.4 
 
 
474 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  49.88 
 
 
432 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  50.12 
 
 
432 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  50.12 
 
 
432 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  53.9 
 
 
411 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  50.12 
 
 
432 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  50 
 
 
433 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  49.88 
 
 
432 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  50.12 
 
 
432 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  49.16 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  48.22 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 
436 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  45.82 
 
 
452 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  48.81 
 
 
436 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  45.82 
 
 
452 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  47.83 
 
 
433 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  46.84 
 
 
433 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  45.82 
 
 
435 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  50.5 
 
 
436 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  44.98 
 
 
435 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  44.98 
 
 
435 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  44.98 
 
 
435 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
433 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
432 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  49.03 
 
 
427 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  39.9 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  39.9 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  35.85 
 
 
424 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  37.25 
 
 
428 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.9 
 
 
441 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
436 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
441 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
432 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  34.87 
 
 
430 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  38.34 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
430 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  35.07 
 
 
424 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.91 
 
 
432 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
431 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
449 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  33.99 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
425 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
426 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
439 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  33.66 
 
 
440 aa  216  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.72 
 
 
424 aa  213  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  33.67 
 
 
442 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  32.59 
 
 
441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  32.59 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  31.51 
 
 
430 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  31.17 
 
 
430 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  32.66 
 
 
441 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  32.66 
 
 
480 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  31.53 
 
 
430 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  31.17 
 
 
430 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  31.53 
 
 
430 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  30.18 
 
 
429 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
454 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  32.66 
 
 
441 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  29.74 
 
 
429 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  31.9 
 
 
439 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
415 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  31.44 
 
 
445 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  31.65 
 
 
442 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.4 
 
 
449 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  32.02 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>