More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2742 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  93.75 
 
 
416 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  96.41 
 
 
417 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  96.33 
 
 
426 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  93.99 
 
 
416 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  92.33 
 
 
416 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  96.17 
 
 
462 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  80.98 
 
 
428 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  37.28 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  36.27 
 
 
413 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  32.77 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  33.17 
 
 
434 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  32.37 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  34.31 
 
 
419 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  29.45 
 
 
415 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  32.29 
 
 
433 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  34.47 
 
 
425 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  32.51 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  32.29 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
421 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  34.95 
 
 
419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  31.78 
 
 
410 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  30.1 
 
 
436 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.89 
 
 
430 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  27.72 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  24.87 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.06 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  24.8 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.13 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.94 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.97 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  24.81 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.97 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.8 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  24.57 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  28.28 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  25 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.37 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.37 
 
 
432 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  28.06 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  27.53 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.51 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  27.29 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.12 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.32 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  26.09 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.53 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  24.73 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.73 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  27.95 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.54 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  25.13 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  30.66 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.27 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  24.87 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  24.87 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  27.21 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.84 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  23.49 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  23.03 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  27.78 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  25.4 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.34 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.89 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.89 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.41 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.89 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  24.68 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.89 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  23.76 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.35 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.25 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.41 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.25 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  26.94 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.8 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  22.74 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.8 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.41 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.41 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.08 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.89 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>