More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5618 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  80.98 
 
 		 418 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  81.71 
 
 		 417 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  78.69 
 
 		 416 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  79.27 
 
 		 416 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  81.46 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  81.46 
 
 		 426 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  78.92 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  37.66 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 410 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  34.43 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  30.86 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  26.38 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.04 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.42 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  24.36 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.77 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.89 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  25.44 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  23.35 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  23.35 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>