More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1001 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  79.8 
 
 		 413 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  100 
 
 		 419 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  92.84 
 
 		 419 aa  708    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  63.93 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  67.16 
 
 		 434 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  65.13 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  64.75 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  66.42 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  66.33 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  55.99 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  35 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  34.02 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.41 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.41 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 436 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 413 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.43 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.38 
 
 		 427 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  23.26 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  23.26 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  23.26 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  34.41 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.96 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.64 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.76 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  31.35 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.43 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  31.35 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>