More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  81.77 
 
 		 413 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  92.84 
 
 		 419 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  67.32 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  65.22 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  64.96 
 
 		 434 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  66.34 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  66.16 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  55.16 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 416 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.58 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 429 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 451 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.14 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  29.25 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.77 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.77 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.77 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.9 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.64 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.18 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.01 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  26 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>