More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  100 
 
 
415 aa  832    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  56.16 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  55.75 
 
 
434 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  55.75 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  54.63 
 
 
413 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  54.79 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  54.79 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  54.86 
 
 
436 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  55.19 
 
 
412 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  55.21 
 
 
419 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  55.99 
 
 
419 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
421 aa  322  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  39.5 
 
 
425 aa  289  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  39.25 
 
 
410 aa  275  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  28.99 
 
 
416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  30.94 
 
 
428 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  29.45 
 
 
418 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  29.33 
 
 
417 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  29.1 
 
 
426 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  29.1 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  29.23 
 
 
416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  29.5 
 
 
416 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  30.22 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  26.48 
 
 
441 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.89 
 
 
444 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.94 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.94 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.13 
 
 
449 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.6 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.8 
 
 
399 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.16 
 
 
455 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
454 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.68 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
454 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  26.64 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  23.42 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  24.22 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  24.94 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  26.38 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.73 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  28.11 
 
 
430 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  25.92 
 
 
461 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  28.42 
 
 
430 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  25.84 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.06 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.46 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.93 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.13 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  25.55 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  28.88 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  24.8 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.31 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.6 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.61 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.38 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.97 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.19 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  23.66 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.88 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.96 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.3 
 
 
439 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.96 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.96 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.96 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  23.43 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  21.25 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.03 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  23.64 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.03 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.38 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.03 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.03 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.03 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.3 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  25.61 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.03 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.3 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.96 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  29.38 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  24.11 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  24.24 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.94 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.76 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.76 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.76 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  21.44 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.36 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.76 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>