More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3427 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  96.17 
 
 		 418 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  93.98 
 
 		 416 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  99.52 
 
 		 426 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  99.28 
 
 		 417 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  93.25 
 
 		 416 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  92.07 
 
 		 416 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  81.46 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  37.06 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  35.54 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 425 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  34.91 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  29.61 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 436 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  24.76 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.41 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  28.22 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  28.42 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  28.23 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 539 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.74 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  26.82 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  24.76 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>