More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1697 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1697  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  926    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  25.65 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  25.33 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  27.54 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  21.35 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  26.5 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  21.11 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.07 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.97 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.73 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  21.39 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.18 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.18 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  21.83 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.21 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.21 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.78 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  26.48 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  23.53 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.74 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  23.14 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  24.92 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  23.84 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.9 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  24.23 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  24.19 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  22.71 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  23.55 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>