197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3902 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
386 aa  754    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  74.09 
 
 
387 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  56.62 
 
 
394 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 
390 aa  347  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
400 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
409 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  22.38 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.51 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.08 
 
 
381 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.35 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.9 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.6 
 
 
384 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.8 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.9 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  26.7 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  21.86 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  22.16 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.31 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  21.85 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  21.85 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.74 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  22.05 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.44 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  22.4 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  21.64 
 
 
425 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
397 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  22.3 
 
 
389 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  22.3 
 
 
389 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  23.39 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.09 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.18 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  19.65 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.8 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  25.26 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.32 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.6 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  26.25 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.29 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  23.47 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  23.99 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.71 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.71 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.71 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.71 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.71 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  23.73 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.34 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  23.78 
 
 
430 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  22.08 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.22 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  27.17 
 
 
397 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.78 
 
 
440 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.78 
 
 
440 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 
522 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.49 
 
 
399 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 
423 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  29.41 
 
 
428 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  25.97 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>