More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0660 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  100 
 
 
361 aa  689    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  67.72 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  59.55 
 
 
360 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  35.57 
 
 
367 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  31.9 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
355 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.56 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.11 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  31.6 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  25.65 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  32.48 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  32.48 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  32.48 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  32.48 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  32.48 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  32.48 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  31.62 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  32.48 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  32.48 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  32.48 
 
 
387 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  30.77 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  25.42 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.56 
 
 
502 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  26.51 
 
 
473 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  31.58 
 
 
582 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  35.25 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  31.62 
 
 
466 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  31.25 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  29.41 
 
 
463 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 
478 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  24.59 
 
 
391 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  24.59 
 
 
391 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 
474 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  25 
 
 
391 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  35.51 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  25 
 
 
391 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  32.31 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  25.33 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  34.78 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
444 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.88 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  28.5 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  27.86 
 
 
452 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.37 
 
 
487 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  34.03 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  34.03 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
525 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  29.44 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  34.03 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  31.48 
 
 
589 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 
483 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  29.57 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 
471 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  31.21 
 
 
475 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.6 
 
 
387 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  24.42 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
434 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
400 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  25.66 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.15 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  25.36 
 
 
477 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  28.85 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  27.37 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  31 
 
 
525 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
474 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
418 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.92 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  27.37 
 
 
469 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
459 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  31.62 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  31.62 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.27 
 
 
492 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  31.82 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  28.08 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
431 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.92 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  34.88 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  27.16 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
393 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  30.66 
 
 
472 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
462 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 
483 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.05 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.05 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 
500 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>