206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2340 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  813    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  56.38 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  19.23 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.12 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  20 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  24.1 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  24.38 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.94 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  20.62 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.97 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  23.27 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.59 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.59 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.64 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  18.28 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  18.28 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 531 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.02 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.02 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  23.48 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.36 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  18.28 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 531 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  25.4 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 657 aa  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  18.28 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  23.12 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  18.6 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.5 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3312  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.12 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  27.12 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  27.12 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.12 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  23.45 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  28.78 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  23.29 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  23.8 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.12 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  21.09 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  22.88 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  26.94 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.7 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  18.6 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  18.4 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>