More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3989 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  82.76 
 
 		 406 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  82.51 
 
 		 406 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  83.25 
 
 		 406 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 406 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 406 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  83 
 
 		 406 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  81.68 
 
 		 406 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  52.36 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  51.65 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  27.62 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  26.65 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  24.06 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.75 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  24.63 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.32 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.38 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  24.56 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.89 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.8 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.8 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  24.1 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  23.85 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.85 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.91 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  30.91 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  23.85 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.91 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  30.91 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.91 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  24.62 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  24.03 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  23.87 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  23.71 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.58 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  27.48 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  25.92 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.1 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.78 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  23.43 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  24.38 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  25.78 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  23.06 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>