More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0065 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  86.63 
 
 		 406 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  812    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  86.88 
 
 		 406 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  99.26 
 
 		 406 aa  809    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 406 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  99.51 
 
 		 406 aa  810    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  55.84 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 415 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  51.5 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  26.15 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.67 
 
 		 420 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 420 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  24.92 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.88 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.45 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.52 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.24 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.24 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.93 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.77 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 476 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  23.15 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  23.51 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  23.82 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.81 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  24.81 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.53 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  22.59 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.81 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  24.13 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  24.59 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  24.63 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  25.87 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  24.46 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.53 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25.91 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.53 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  24.44 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.44 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30.06 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  23.76 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.29 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.88 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.83 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>