141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1480 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  761    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 
407 aa  324  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
425 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  41.19 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
388 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  31.15 
 
 
386 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  33.25 
 
 
392 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  32.21 
 
 
394 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  33.53 
 
 
389 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  31.59 
 
 
393 aa  193  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  33.51 
 
 
394 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
394 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  34.53 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  32.75 
 
 
414 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
393 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  28.12 
 
 
408 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  32.78 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  31.77 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.77 
 
 
440 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
395 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.18 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.65 
 
 
505 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.91 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  20.82 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  25.82 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.82 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.78 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  23.78 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  23.78 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  23.39 
 
 
507 aa  67  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  21.82 
 
 
433 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.05 
 
 
419 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  28.12 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  26.07 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  31.32 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  31.32 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  28.8 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  31.17 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  30.87 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.51 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.45 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.91 
 
 
415 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.45 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.45 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.57 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  28.05 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.45 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  24.71 
 
 
474 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.05 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.97 
 
 
274 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  21.75 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  28.19 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  21.75 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 
529 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  27.8 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  21.82 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
415 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 
406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  22 
 
 
406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  23.29 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  27.78 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.87 
 
 
439 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.87 
 
 
439 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25.14 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
485 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.87 
 
 
439 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.18 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  25.85 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.26 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  29.26 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  23.54 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  24.42 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  26.98 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  28.29 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.91 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.77 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  23.2 
 
 
431 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  24.23 
 
 
386 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.55 
 
 
440 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26 
 
 
401 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  23.81 
 
 
431 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26 
 
 
401 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>