67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0861 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
387 aa  729    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
395 aa  271  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
390 aa  219  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
417 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  21.65 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  25.86 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  26.93 
 
 
428 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.84 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
386 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  26.58 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
409 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  21.46 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  25.98 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.1 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  22.94 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
219 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
409 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.23 
 
 
388 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  22.84 
 
 
370 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.97 
 
 
391 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.22 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
504 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  21.34 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  21.34 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  21.34 
 
 
400 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  24.1 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  24.48 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  23.24 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  27.05 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  21.18 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.69 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  25.19 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.56 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  24.55 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.7 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  25.51 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.64 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.37 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.42 
 
 
532 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  23.91 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  21.68 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  23.91 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  23.91 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.71 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  21.68 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  21.68 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.09 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  19.64 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  19.64 
 
 
406 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.91 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  19.64 
 
 
406 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>