93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4635 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  848    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  49.16 
 
 		 421 aa  408  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  48 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  47.47 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.03 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  29.52 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  29.52 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  29.52 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  32.03 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  29.52 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  29.03 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  30.47 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  30.47 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  30.47 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  30.47 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  35.14 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  26.63 
 
 		 493 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 409 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  30.47 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  30.47 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  30.47 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  26.22 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  23.53 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.91 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  30 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  27.94 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.26 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.95 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  24.09 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.63 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  25 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  24.84 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.49 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  21.27 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  22.15 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  26.82 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>