65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0364 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  838    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  65.74 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  65.75 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 416 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  41.33 
 
 		 421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.36 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.36 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  25.42 
 
 		 477 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  21.17 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  27.03 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  27.03 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  27.03 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  22.86 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  26.29 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  26.26 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  26.29 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.34 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  27.27 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  22.63 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  22.63 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  26.14 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  27.01 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  23.04 
 
 		 440 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.57 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>