157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0878 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 		 352 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.38 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  24.87 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  26.37 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  23.25 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  26.95 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  27.74 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  25.67 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  25.56 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  28.25 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  31.2 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  24.9 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  26.36 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  23.34 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  25.77 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  25.66 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  25.93 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28.38 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.5 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  25.98 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  25 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  25.59 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  25.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  25.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  25.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  25.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  25.59 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  25.59 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  25.98 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  23.33 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>