225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2808 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  767    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  60.16 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  43.53 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  44.35 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  46.09 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  42.27 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  43.05 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 439 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  40.91 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.88 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 378 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.69 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.75 
 
 		 397 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.17 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 441 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  34.07 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.07 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.44 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  32.05 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  37.47 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  29.59 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.97 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  29.62 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  29.27 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 373 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.41 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25.47 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  33.24 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  33.5 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28.14 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>