212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1047 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
387 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
378 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.97 
 
 
384 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
387 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.61 
 
 
386 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
385 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.41 
 
 
396 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
387 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  38.11 
 
 
443 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
386 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  34.56 
 
 
391 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.23 
 
 
398 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.11 
 
 
405 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  33.51 
 
 
396 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
397 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  39.72 
 
 
388 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
388 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  32.86 
 
 
397 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.75 
 
 
400 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.16 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
403 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
377 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  31.34 
 
 
397 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  36.11 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  35.24 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
413 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  38.33 
 
 
393 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
389 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.54 
 
 
441 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  35.15 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.56 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
433 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.6 
 
 
400 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  34.63 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  34.63 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  34.63 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
470 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.33 
 
 
384 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  34.32 
 
 
388 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.97 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  35.25 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.1 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
391 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  30.19 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.42 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  33.15 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  33.51 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.7 
 
 
403 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  33.51 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  33.51 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  33.51 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  33.51 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
409 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 
408 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
383 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  37.36 
 
 
392 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
427 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
385 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.52 
 
 
432 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.69 
 
 
377 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  33.24 
 
 
378 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 
407 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.88 
 
 
385 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  33.06 
 
 
387 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  33.06 
 
 
387 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.88 
 
 
385 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  35.26 
 
 
384 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.61 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  29.11 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.61 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  29.11 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.61 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
395 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.61 
 
 
402 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
465 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.34 
 
 
402 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
415 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  32.8 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  28.84 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.34 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.47 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  32.97 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  30.34 
 
 
402 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
405 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  28.84 
 
 
403 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.62 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  28.84 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
398 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>