232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4303 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  60.82 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  53.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  53.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  53.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  53.62 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  52.56 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  52.55 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 391 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  52.55 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  52.41 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  52.41 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  52.41 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  53.82 
 
 		 375 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  47.69 
 
 		 390 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  52.99 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  42.97 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  42.97 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  42.97 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  42.11 
 
 		 397 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  40 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  47.89 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 480 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  32.38 
 
 		 502 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  47.02 
 
 		 182 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  41.62 
 
 		 207 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.24 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.04 
 
 		 384 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.51 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.13 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.79 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  30.58 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.79 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  31.23 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  30.62 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  30.62 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  30.62 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  30.62 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>