218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2714 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  88.12 
 
 
417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  82.55 
 
 
404 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  50.77 
 
 
388 aa  332  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  47.37 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  47.55 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 
397 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
413 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 
402 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  34.7 
 
 
397 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  34.69 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  38.68 
 
 
402 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  39.47 
 
 
402 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  38.68 
 
 
402 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
402 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  38.68 
 
 
402 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  38.68 
 
 
402 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  38.68 
 
 
402 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  38.42 
 
 
402 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  37.6 
 
 
404 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  38.48 
 
 
375 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
433 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  38.2 
 
 
403 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  38.2 
 
 
403 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  37.93 
 
 
403 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 
395 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  38.16 
 
 
403 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  38.42 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  32.99 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  32.99 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  33.16 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
446 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
443 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  37.7 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 
397 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  40.95 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  38.98 
 
 
414 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.73 
 
 
502 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  35.53 
 
 
390 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.68 
 
 
384 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  37.6 
 
 
282 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.85 
 
 
398 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
385 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
381 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.75 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.25 
 
 
417 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  41.1 
 
 
182 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
387 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.18 
 
 
397 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.97 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
396 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  35.43 
 
 
400 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 
465 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
391 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.5 
 
 
383 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 
470 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.79 
 
 
384 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
394 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.41 
 
 
432 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
387 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.78 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  35.77 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  32.25 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.35 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  32.16 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  35.31 
 
 
403 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.51 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  34.05 
 
 
403 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.71 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
378 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.39 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  22.97 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  33.24 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
386 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  32.98 
 
 
419 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
390 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
407 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.91 
 
 
395 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>